Спустя пять лет после эпохальной битвы с огромным чудовищем древней эпохи Мегалодоном, брутальный ныряльщик и исследователь океанских глубин Джонас Тейлор, проникается важностью защиты окружающей среды от человеческих действий и становится убежденным экологом. Во время выполнения очередной благородной миссии, он проникает на борт судна, чей экипаж под предлогом перевозки горючего, злодейски сливает в воду радиоактивные отходы. Бесшумной тенью добравшись до судовых документов, мужчина фотографирует компрометирующие данные, а затем пробивается на свободу, легко и уверенно расшвыривая и калеча моряков и охрану. Спасенный соратниками, Джонас отправляется вместе с приемной дочерью Мэйин в район Марианской впадины, где группа неких злоумышленников ухитрилась захватить батискаф Мана-1. В это время молодая самка мегалодона по кличке Хайки, содержащаяся в неволе, неожиданно вырывается на свободу и несется к той самой впадине, где родилась и выросла. Это обещает встречу всех героев в одном месте, но не сулит им ничего хорошего.
